Si vous n’avez jamais joué au Sudoku, les règles sont d’une grande simplicité. Le but de ces puzzles de logique numérique est de placer des chiffres allant de un à neuf dans chaque case d’une grille formée de neuf cases elles-mêmes divisées en neufs cases. Chaque puzzle démarre avec quelques chiffres déjà positionnés dans certaines cases – ce sont des indices. Lorsque le niveau de difficulté des puzzles augmente, le nombre de ces indices diminue. Ensuite c’est au joueur de faire en sorte qu’on ne retrouve qu’une seule fois les chiffres de un à neuf dans chaque rangée, colonne et sous grille de trois cases sur trois.

Sudoku Master contient trois niveaux de difficulté de façon à ce que chacun trouve les puzzles qui lui conviennent. La résolution des puzzles varie en fonction des personnes; cela demande de 10 à 30 minutes par puzzle selon ses aptitudes et son expérience. Pour les nouveaux venus au Sudoku, le jeu offre un mode entraînement dans lequel les chiffres incorrectement placés deviennent automatiquement rouges. En plus de cela, un tutorial complet explique les règles du jeu et offre également des petites astuces bien appréciables. Plus la résolution d’un problème sera rapide, plus le nombre d’étoiles sera important. Lorsque vous avez récupéré assez d’étoiles, il est possible d'accéder au Rank Mode. Dans ce mode, le défi proposé est de compléter des puzzles dans un laps de temps déterminé pour obtenir un grade. Plus le défi est accompli rapidement plus haut sera le grade.