Un bug présent dans Metroid : Other M sur Wii (une porte qui ne s'ouvre pas toujours dans le Sector 3), oblige les joueurs à recommencer leur partie depuis une précédente sauvegarde. Une opération qui ne fonctionne cependant pas toujours. Nintendo Japon a donc mis en place un service d'aide, et les joueurs nippons peuvent envoyer leurs fichiers de sauvegarde (ou la console Wii complète) au service client du constructeur, pour que Nintendo résolve le bug de sauvegarde. Rien de similaire n'est pour le moment prévu en Europe.