Kensube Tanabe, producteur de la série Metroid Prime, a une nouvelle fois mentionné un probable retour du jeu dans un futur proche.

"Nous considérons toujours le multijoueur pour la série Metroid Prime. Par exemple, je pense que je pourrais mettre en place des idées uniques pour utiliser le Morph Ball" a t-il déclaré.

Le prochain Metroid sortira en 2010, et sera développé par la Team Ninja. Un éventuel Metroid Prime 4 ne devrait donc pas voir le jour avant la prochaine Wii.