Toneriko est le Number 5 de l’organisation de tueurs d’élite Thanatos composée des dix meilleurs assassins du monde. Son souhait le plus cher est de devenir le numéro 1 afin de tuer le meurtrier de sa famille : Tekirai, l’actuel Number 1. Parviendra-t-il à atteindre son but sans y laisser son âme ?

La lutte pour le classement de n°1 fait rage. Le héros principal de la série est seulement classé cinquième pour le moment. Dans le premier tome, nous apprenions que sa famille a été tué il y a près de dix ans par Tekirai, alors qu'il n'était qu'un enfant. C'est pourquoi il a rejoint le groupe, et pour sa défense, il utilise deux pistolets "Evergreen" pour le moins étranges. Tekirai est quant à lui friand des épées et dispose d'un modèle très spécial sur le dos, la "World End". Le casting des tueurs est assez éclectique, et en parallèle, on découvrira d'autres visages plus sympathiques tels que Mikuria Mizuto, un ami de Toneriko qui a la capacité de guérir les blessures. En outre, une organisation luttant contre Thanatos, Echo, est composé de ses anciens membres refoulés. Akagane en fait parti, et est en lutte contre Tekirai qui a ruiné sa vie. Bref, Toneriko continue son combat contre Sakura, et le duel semble tourner à l'avantage de ce dernier. La rage de vaincre semble avoir quitté Toneriko, et l'issue semble mal engagé. Mais la provocation gratuite de Sakura, et surtout l'évocation de Tekirai éveillent en lui l'envie de découdre. Toneriko ne semble plus être le même à présent ...