Ubisoft a publié un patch Day -One pour Assassin's Creed Shadows , apportant plusieurs changements pour améliorer l'expérience de jeu et répondre à certaines controverses. Parmi les changements les plus notables, les tables et les étagères à l’intérieur des temples et des sanctuaires sont désormais indestructibles . Ce changement semble être une réponse directe aux inquiétudes de certains politiciens japonais, qui craignaient que la possibilité de détruire des éléments de bâtiments sacrés dans le jeu puisse inspirer du vandalisme dans le monde réel. La controverse a éclaté lorsque le politicien japonais Hiroyuki Kada a soulevé la question lors d'une conférence gouvernementale , affirmant que Shadows permettait aux joueurs d'attaquer et d'endommager des sanctuaires du monde réel sans autorisation. Le Premier ministre Shigeru Ishiba a répondu en soulignant l'importance du respect de la culture et de la religion locales, affirmant que la question serait discutée avec les ministères concernés. Ce débat a notamment surgi après que certaines vidéos de pré-lancement ont montré la possibilité d'endommager le sanctuaire Itatehyozu , un sanctuaire situé à Himeji, dans la préfecture de Hyogo, qui se trouve en plein dans le district de Kada.

Ubisoft, probablement pour éviter de nouvelles critiques, a agi rapidement en publiant ce patch. En plus de l'indestructibilité des tables et des étagères, la mise à jour a également introduit d'autres améliorations : les citoyens non armés ne saignent plus lorsqu'ils sont attaqués (réduisant les scènes de violence dans les lieux sacrés), les problèmes d'éclairage dans les grottes et les bâtiments ont été corrigés, la navigation des chevaux a été améliorée et certains bugs liés aux tenues des protagonistes Yasuke et Naoe ont été corrigés.