Takaya Imamura, le directeur de Steel Diver: Sub Wars (3DS) a annoncé l'arrivée de la version 3.0 du jeu. Cette dernière vous permettra d'affronter vos amis en mode Bataille en ligne. Ainsi, si vous disposez d'une connexion internet sans fil, vous pourrez jouer avec les amis enregistrés sur votre Nintendo 3DS à tout moment ! Attention cependant, cela n'est possible qu'avec la version premium.  De plus, l'éditeur va rajouter deux arènes réservées au mode Bataille en local, qui seront également disponibles en mode Bataille en ligne si vous jouez avec vos amis. Vous pourrez aussi débloquer de nouveaux sous-marins en jouant en mode Bataille en local un certain nombre de fois.Si vous avez joué dans ce mode avec la version 2.0, vos parties seront prises en compte dans la version 3.0. Ainsi, si vous avez déjà dépassé le nombre de parties requis, vous débloquerez ces sous-marins tout de suite après avoir installé la mise à jour. Encore une fois, n'oubliez pas qu'ils ne sont disponibles que pour les utilisateurs de la version premium. 

Enfin, Nintendo a également l'intention d'ajouter huit nouveaux membres d'équipage, dont certains sont capables de larguer des mines sous-marines en activant le Masker ou encore de régénérer leurs alliés.  D'autres changements sont aussi notifié : par exemple, vos alliés ne recevront pas de dommages si vous les touchez par accident et vous pourrez envoyer des messages en morse avec la manette +.  Enfin, les utilisateurs de la version gratuite auront accès à la boutique du jeu jusque-là réservée aux utilisateurs de la version premium, et l'accès au mode Bataille en ligne de la version gratuite ne nécessitera plus qu'une seule pièce de jeu au lieu de deux.