Résumé : Un jour, en se réveillant, Seiji découvre avec stupeur qu'à la place de sa main droite, il y a maintenant une fille, Kasuga Midori, et qu'en plus elle est folle de lui. Il va alors devoir gérer tant bien que mal cette nouvelle situation.

Midori Days continue de nous conter le quotidien de Seiji et Midori qui vont devoir se sortir de situations pour le moins alambiquées. Miku, la reine des racailles (comme elle se présente) est tombée amoureuse de Kota. Takamizawa l'otaku de service, a quant à lui percé le secret de Midori, et s'apprête à faire chanter Sawamura si celui-ci ne lui prête pas sa main droite. Mais Sawamura n'a pas le temps de s'en occuper : Quelqu'un s'est emparé de l'image de Midori pour en faire une superstar sur Internet, et une nouvelle élève américaine, Lucy, vient d'arriver dans sa classe.