Charlie Harper (Charlie Sheen) mène une vie de célibataire de rêve ; il habite une maison sur la plage de Malibu, gagne très bien sa vie et enchaîne les conquêtes amoureuses. C'est alors que son frère aîné Alan, en plein divorce, emménage chez lui avec son fils Jake, âgé de 10 ans. Une cohabitation plus que mouvementée va commencer entre les deux hommes, que tout oppose, et ce petit garçon qui va bouleverser la vie de Charlie. La saison 2 de Mon Oncle Charlie comprend 24 épisodes dont voici un résumé :

Episode 1 : Frères ennemis
Alan apprend que Charlie fait parti d'un groupe de musique, et qu'il va devoir quitter la maison, son frère ne désirant pas qu'il soit là quand il les recevra.

Episode 2 : Un fils ingrat 
Judith a rendez-vous chez le pédiatre de Jake. Alan avoue qu'il sera embêté que cette dernière se remarie, mais pour Charlie, cela signifie aussi la fin des pensions ...

Episode 3 : Une maîtresse pas comme les autres
Charlie essaye d'éviter un renvoi de Jake de son école, et n'hésite pas pour cela, à séduire son institutrice.

Episode 4 : Le soutien-gorge de Maman
Jake ne fait que de parler du nouveau petit-ami de sa mère Judith, ce qui ne tarde pas d'énerver Alan. Pendant ce temps Evelyn emprunte la voiture de Charlie ...

Episode 5 : Charlie et son double
Charlie participe à un match, quand il tombe sur une femme qui joue de façon encore plus agressive que lui.

Episode 6 : Une bonne pâte
Alan nie avoir volé un jouet dans un magasin. En réalité, Charlie est responsable, et l'a caché dans une poche d'Alan pour éviter lui même d'être accusé.

Episode 7 : Charlie et le traiteur
Alan et Charlie organisent une petite fête pour Evelyn. Mais cela ne va pas se passer pour le mieux quand leur soeur va arriver.

Episode 8 : Obsession
Alan a rencontré une jeune femme nommée Nancy. Tout se passe pour le mieux, jusqu'à ce que leur relation évolue ...

Episode 9 : Courage, fuyons
Charlie fait la connaissance de Lisa, la femme idéale. Mais quand il apprend qu'il risque de compromettre son mariage, Charlie a alors peur de la suite des évènements.

Episode 10 : Allons voir si la rose
Charlie écrit la musique d'un nouveau dessin animé, mais Jake déteste cette chanson.

Episode 11 : Internet c'est pas toujours net 
Charlie se montre surpris quand il rencontre Gail, une de ses ex. Elle lui apprend qu'un site recense tous ses exploits amoureux.

Episode 12 : Une brise printanière
Charlie rencontre une ancienne camarade de classe, devenue une superbe femme, ce qui a le don d'agacer Alan, jaloux.

Episode 13 : La fiancée venue du froid
Alan invite Judith chez Charlie, suite à la destruction de sa maison par un violent tremblement de terre.

Episode 14 : Grand-Mère indigne
Evelyn critique Alan à propos de l'éducation de Jake. Alan et Charlie la mettent donc à la porte.

Episode 15 : Charlie garde-malade
Alan est inquièt à propos d'une intervention qu'il doit subir. Charlie l'invite donc à Las Vegas pour décompresser.

Episode 16 : Qui aime bien, oublie bien 
Judith a décidé de partir une semaine en vacances. Conséquence de quoi, Alan et Charlie vont devoir s'occuper de Jake pendant sept jours.

Episode 17 : Le mal de dost
Victime d'un terrassant mal de dos, Alan est envoyé à l'hôpital par Charlie. Ce dernier semble reconnaître son médecin, mais ne parvient pas à se souvenir où il l'a croisée.

Episode 18 : Troubles érectiles
Charlie est invité à une soirée par un directeur d'annonce gay. Il décide donc de jouer la comédie et fait passer Alan pour son partenaire. 

Episode 19 : Fiancé de substitution
Alan et Charlie rencontrent Sherri, une ex de ce dernier. Alan, sous le charme, décide donc de la conquérir, avec la bénédiction de son frère.

Episode 20 : Faux frères 
Judith a acheté une paire de baskets hors de prix à Jake, ce qui énerve Alan.

Episode 21 : Drague à l'enterrement
Evelyn apprend la mort de Harry, son ex (second) mari. Elle est furieuse quand elle apprend qu'Alan avait gardé le contact avec lui.

Episode 22 : Ma vieille peau de mère
Evelyn a offert une Porsche à Alan, ce qui énerve Charlie. Parallèlement Alan a rendez-vous avec Trudy, dont le père intéresse fortement Evelyn.

Episode 23 : Soirée de folie
Evelyn apprend que Jake passe toutes ses vacances chez ses grands-parents maternels. Elle réclame donc à Alan le droit de garder son petit-fils pour une nuit.

Episode 24 : La fiancée de Grand-Père
Jake doit raconter dans une rédaction ce qu'il a fait ce week end. Problème, Charlie a rencontré une jeune femme Nathalie, mariée avec une vieil homme, Norman, qui est venu la chercher chez lui.

Coté bonus, aucun supplément n'est cette fois présent sur les trois DVD composant le coffret.