Prenant place dans une époque contemporaine, Carthago s'intéresse à un problème lui aussi actuel : la raréfaction des ressources gazières et pétrolières. De ce fait, il faut trouver de nouvelles sources d'énergie, et exploiter jusqu'à la lie les derniers gisements disponibles. Une équipe décide d'explorer les fonds sous-marins, encore vierge de tout intrus, à la recherche d'une solution viable.  Quelle erreur n'ont-ils pas fait ! Lors d'un forage, les scaphandriers sont attaqués par un mégalodon, un ancêtre du requin blanc, et qui se montre beaucoup plus coriace que ce dernier. Rien que sa taille (25 mètres) donne une idée de l'apparence de l'animal. Le pire reste que cette espèce est censée avoir disparue de la planète depuis 5 millions d'années. Pourtant l’océanographe Kim Melville va en découvrir des dizaines d'individus, ce qui risque de compliquer l'expédition et pourrait même corrompre le projet tout entier. Ajoutons à cela que la fille de l'héroïne, Lou, semble pouvoir communiquer avec un mégalodon, alors que ce dernier commence à s'attaquer aux humains.  Bien entendu, le riche collectionneur autrichien Wolfgang Feiersinger cherche toujours à capturer l'animal, quel qu'en soit le prix, mais une entité adverse va finalement prendre tout le même de vitesse et installer un de ses énormes requins dans un parc aquatique près de Dubaï ...

Pendant ce temps, la carcasse d'un autre requin est retrouvée en Malaisie, échouée après un tsunami. Forcément, il devient difficile de dissimuler cette découverte au public, surtout qu'une meute de journaliste est déjà sur place pour couvrir l'évènement. Le Centenaire des Carpartes décide de lancer une nouvelle expédition marine sur le site de Koubé avec le même équipe, excepté Kim. Cette dernière a décidé de se retirer dans une contrée désertique, et de s'occuper pleinement de sa fille.