Ki-Itchi raconte une partie de la vie d'un jeune garçon, Ki-Itchi Someya, depuis ses 3 ans. Son caractère, colérique parfois, extrêmement affirmé toujours, son mutisme, sa hargne et son sens encore incertain de la justice, oblige sa mère à s'excuser sans fin auprès des autres parents d'enfants qu'il frappe, apparemment sans raison. Confronté à l'assassinat de ses parents à l'âge où d'autres sont au bac à sable, il fugue, puis est recueilli par des clochards, devient autonome, est recherché par la police, découvre sans bien le comprendre le monde des adultes et passe trois mois seul dans la montagne. Son retour, puis sa vie d'écolier japonais, son sens brutal du bien et du mal, vont changer à jamais la vie de ceux qu'il côtoie.

Il s'agit d'un manga atypique sur le Japon contemporain et la relation aux autres, à la société, à ce qui est bien, mal ou conventionnellement admis, à travers le regard sans concession de Ki-Itchi. Ki-Ichi VS est une suite directe, et le personnage a ici pris quelques années, et va se battre contre tout ce qui ne va pas dans la société.